Это закон подлости! У меня так же было, катался недалеко от гаража минут двадцать, все нормально было. Решил проехаться по городу,отъехал километров на пять и вдруг просто заглох. Я его и с толкача и с горки , ну ни в какую не хочет, даже признаков не подает. Искра есть бензин поступает, чего ему надо не пойму! Так и толкал до гаража. Дотолкал, высказал все что о нем думаю, дернул кикстартер и он завелся как ни в чем не бывало. Кататься уже не было ни сил, ни желания. Потом заменил свечу на НЖК и тьфу- тьфу- тьфу, едет теперь без проблем.
В твоем случае посмотри реле регулятор. Во время работы мотоцикла отсоедини аккумулятор, если заглохнет значит нет зарядки,поэтому мотоцикл через некоторое время и не заводится.А как постоит немного, аккумулятор немного восстановится и мотоцикл опять подает признаки жизни. Еще как вариант, ключ в положении 5 и мотоцикл должен работать без аккумулятора.